◆ 緑色蛍光を発するタンパク質／GFP（Chime版） ◆
※詳細版（分子表示はJmol形式）
※本ページは「@nifty「化学の広場」2001年4月の分子の内容にデータを追加したものです。

　美しい緑色の蛍光を発するタンパク質GFP（Green Fluorescent Protein）は，Yahoo!のカテゴリー（英文）が設けられているほど注目されているタンパク質で，様々な研究に用いられています。
　ここでは，「高校化学グランプリ2000」の一次選考の問題に出ていた化合物の話題を紹介しましょう（PDFデータで問題・解答参照可）。以下の蛍光発生部分の分子構造について，その構成アミノ酸単位を見つける問題です。図中の□にならって，アミノ酸単位を枠線で囲んでみましょう。ただし，単結合が二重結合に変化しているものがあるほか，新たに生成している炭素-窒素結合が１つあることに注意してください。

●データ引用：工藤一秋，『化学グランプリ2000第一次選考報告（その2）』，化学と教育，2001年4月号，p.228

※参考：アミノ酸の分子構造図の例


問題　GFP（Green Fluorescent Protein）の蛍光発生部分の構造（答はこのページの最後）

GFP関連PDBデータ例
初期表示は1HCJ（Photoproduct Of The Wild-Type Aequorea Victoria Green Fluorescent Protein）のChain A

 1HCJのChain A（Green Fluorescent Protein；元データ1HCJ）
　　 下記解答の原子団を色分け（赤：発色団，青：PHE，緑：VAL，水色：GLN）
　　 同原子団の選択 ｜ 発色団共役二重結合をピンク表示
　※ 1HCJ Chain Aの蛍光発生部分
1GGXのChain A（Red Fluorescent Protein；元データ1GGX）
　　 Ligandを赤色表示 ｜ 発色団共役二重結合をピンク表示

Cartoon　 Backbone　 2nd Structure　 Termini
Ligands表示　 OFF

Protein選択　 Ligand選択
 空間充填　 球棒モデル　 スティック　 OFF
CPK　 amino
Dot Surface表示　 OFF
水素結合表示（細）　 同（太）　 OFF
光沢表示　 OFF　｜　 光量30%　 OFF
軸表示　 OFF　｜　 Bounding Box表示　 OFF
背景・黒　 背景・灰　 背景・白
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amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO

※他の情報は詳細版（分子表示はJmol形式）に移動しました。


解答　GFP（Green Fluorescent Protein）の蛍光発生部分の構造


3次元構造例（初期座標は適当で，MM2計算後末端原子をLpに変更）

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