前回の鳥インフルエンザ関連のヘマグルチニンに続いてインフルエンザ関連で,今回はA型ウイルス(サブタイプN2)のノイラミニダーゼ分子の例です。
参考:鳥インフルエンザ情報(リンク資料など)
※細胞表面などから離脱する働きをもつノイラミニダーゼはシアル酸加水分解酵素でシアリターゼ(sialidase)ともいう
※ノイラミニダーゼほかインフルエンザウイルスについては以下を参照◎平山令明,「分子レベルで見た薬の働き」,pp.198-209,講談社ブルーバックス(1997)
※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO
= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET PHE TYR TRP LYS ARG HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP
※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE
※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP
※有機概念図I/O値順(特性基 R)
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS
TYR TRP CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE
※同上(アミノ酸)
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE
※参考:阻害剤Aromatic Bana109のSITE部分の強調表示および抽出データの画像 → PDBデータのLigand結合部位
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