◆ 今週の分子 ◆
★連載59(2004/06/09〜):
ニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質(PDBデータ1UW6より)

 5月31日は世界禁煙デーでした(厚生労働大臣メッセージ)。4月には『たばこがなければ、毎年9万人がん患者減 厚労省研究班』(朝日新聞,2004/04/23)というニュースも出て話題になりました。そこで今回取り上げたのはニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質(Achbp)の例です。
 なお関連で,ニコチン性アセチルコリン受容体(AChR)は禁煙やアルツハイマー病,神経ガス,有機リン中毒などいろいろな話題に登場しますのでWeb検索してみるといいでしょう。


ニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質の例
1uw6のChain A-E)

※アセチルコリン受容体データ例:1oedeProtS資料

Backbone Termini 2nd Structure
Ligands表示 OFF
Water表示 OFF

Protein選択
Ligand選択 Water選択 全選択
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino | ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順(Protein)
log P値順(Protein)
有機概念図I/O値順(Protein特性基 R)| 同(アミノ酸)
Dot Surface表示 OFF
Specular OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
画像をクリップボードへコピー


※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO
 CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP

※有機概念図I/O値順(特性基 R
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS
TYR TRP
 CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE

※同上(アミノ酸)
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS
 CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE


1uw6のChain A-EとそのSITE部分例(PDBデータのLigand結合部位で作成)
※SITE部分は,ニコチンを親油ポテンシャル表示,アミノ酸は酸性中性芳香族〉・塩基性区別表示,赤球は水分子の酸素


「生活環境化学の部屋」ホームページ「分子の形と性質」学習帳「今週の分子」トップ