◆ 今週の分子 ◆
★連載59（2004/06/09〜）：ニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質（PDBデータ1UW6より）

　5月31日は世界禁煙デーでした（厚生労働大臣メッセージ）。4月には『たばこがなければ、毎年９万人がん患者減　厚労省研究班』（朝日新聞，2004/04/23）というニュースも出て話題になりました。そこで今回取り上げたのはニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質（Achbp）の例です。
　なお関連で，ニコチン性アセチルコリン受容体（AChR）は禁煙やアルツハイマー病，神経ガス，有機リン中毒などいろいろな話題に登場しますのでWeb検索してみるといいでしょう。


ニコチンが結合したアセチルコリン結合性タンパク質の例
（1uw6のChain A-E）

※アセチルコリン受容体データ例：1oed → eProtS資料

Backbone Termini 2nd Structure
Ligands表示 OFF
Water表示 OFF

Protein選択
Ligand選択 Water選択 全選択
 空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino ｜ ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
hydropathy index順（Protein）
log P値順（Protein）
有機概念図I/O値順（Protein特性基 R）| 同（アミノ酸）
 Dot Surface表示 OFF
Specular OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※hydropathy index順
ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP
SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
※log P値順
ARG　ASP　ASN　GLU　GLN　HIS　GLY　SER　LYS　THR
ALA　PRO　CYS　VAL　TYR　MET　ILE　LEU　PHE　TRP
※有機概念図I/O値順（特性基 R）
ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS
TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE
※同上（アミノ酸）
GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS
VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE


1uw6のChain A-EとそのSITE部分例（PDBデータのLigand結合部位で作成）
※SITE部分は，ニコチンを親油ポテンシャル表示，アミノ酸は酸性・中性〈芳香族〉・塩基性区別表示，赤球は水分子の酸素

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