◆ 今週の分子 ◆
★連載78(2004/12/15〜):
フィブリノゲンの例(PDBデータ1LTJより)

 血液製剤フィブリノゲンがC型肝炎ウイルスの感染を広めたとして大きな問題となっています。薬害エイズの経験が活かされなかったという指摘もあります。フィブリノゲンは繊維素原とも言い.脊椎動物の血漿中含まれていて,血液凝固の際に中心的役割を果たす糖タンパク質です。今回はそのフィブリノゲンタンパク質の部分構造例を取り上げました。

C型肝炎ウイルス検査受診の呼びかけ(厚生労働省,2004/12/09)基本的なQ&A
フィブリノゲン製剤によるC型肝炎ウイルス感染に関する調査報告書〔概要〕(厚生労働省,2002/08/29)


フィブリノゲンタンパク質のフラグメントDの部分構造例
1LTJのChain A,B,C,G,H)
    ※初期表示の説明(特殊表示のためPDBデータの原子団No.を一部変更)
  • タンパク質はバックボーン表示
  • S原子は空間充填&CPK色
  • G鎖(Gly-Pro-Arg-Pro)・H鎖(Gly- His-Arg-Pro)は空間充填&アミノ色
      G・H鎖選択
バックボーン 二次構造
リガンド表示 OFF

タンパク質選択
リガンド選択 全選択
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK amino | ラベル表示 OFF
酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
疎水性インデックス順(タンパク質)
log P値順(タンパク質)
有機概念図I/O値順(Protein特性基 R)| 同(アミノ酸)
水素結合(細) 同(太) OFF
S-S結合(太) OFF
S原子(Protein中)空間充填
ドット表面表示 OFF
光沢表示 OFF 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
ARG ASP ASN GLU GLN HIS GLY SER LYS THR
ALA PRO
 CYS VAL TYR MET ILE LEU PHE TRP

※有機概念図I/O値順(特性基 R
ASN SER ASP GLN GLU THR ARG HIS GLY LYS
TYR TRP
 CYS MET PRO PHE ALA VAL LEU ILE

※同上(アミノ酸)
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS
 CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE


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