◆ 今週の分子 ◆
連載99（2005/10/05〜）：ピロリ菌由来タンパク質の例（PDBデータ1JI4）
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　一昨日発表された2005年のノーベル生理学医学賞はピロリ菌の研究で，オーストラリアの研究者2人に贈られました。そこで今回は，受賞の研究とは直接関係ありませんが，ピロリ菌由来のタンパク質から，好中球活性化タンパク質NAPの例を取り上げました。他のデータについてはProtein Data Bank (RCSB PDB)で“Helicobacter pylori”をキーワードにして検索するとよいでしょう（Full Text Search 指定）。


ピロリ菌由来タンパク質の例（1JI4）
Nap Protein From Helicobacter Pylori
 バックボーン 二次構造
リガンド表示 OFF

全選択 リガンド選択
タンパク質全選択
空間充填 球棒 スティック OFF
CPK アミノ色 ｜ ラベル表示 OFF

酸性・中性・塩基性アミノ酸区別
極性・非極性区別
疎水性インデックス順
log P値順

水素結合（細） 同（太） OFF
ドット表面表示 OFF
光沢表示 OFF ｜ 光量30% OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白
回転 OFF
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※amino表示の凡例
ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR
ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO
＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝
※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR
ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS
※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別
SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG
HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP
※hydropathy index順
ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP
SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE
※log P値順
ARG　ASP　ASN　GLU　GLN　HIS　GLY　SER　LYS　THR
ALA　PRO　CYS　VAL　TYR　MET　ILE　LEU　PHE　TRP

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