◆ Jmolアニメーション(PDB 1f88) ◆

JmolによるPDBデータ表示例
※初期表示は1f88 Chain Aのアニメーション表示(loopアニメ)

1f88のChain A ※参考:SOSUI・TMHMMを利用した演習(Chime版)
1a02のChain F・J+DNA ※Leucine Zipperの例

バックボーン 二次構造
DNA/RNA(ATGCU
空間充填 球棒 同(球大き目) 針金
アミノ色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 等電点順
水素結合(太) OFF
S-S結合表示(太) OFF
S原子(Protein中)空間充填
ドット表面表示 OFF
回転 OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白


※amino表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

= 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 =
酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※疎水性インデックス順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP
VAL GLY LEU
 ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG


「生活環境化学の部屋」ホームページJmol版「分子の形と性質」学習帳Chime版「分子の形と性質」学習帳