図１　セントラルドグマとRNAワールド
※以下に掲載の図を改変；柳川弘志，「生命はいかに創られたか」，TBSブリタニカ(1991)

図２　tRNAを含むPDBデータ例（1g59より，PDB部分データリストにも収録）；拡大
Glutamyl-tRNA Synthetase Complexed With tRNA(Glu).
［左］tRNAのL字型三次構造の骨格，［中］1g59のChain B（tRNA^Glu），［右］1g59のChain A・B（tRNA^GluとGluRSの複合体）
※中・右の図では，RNAは球棒（塩基の色は下表と同じ），タンパク質はスティック（色は下表amino形式）表示
◎中村義一 編，「RNAがわかる」，p.90，羊土社(2003)

mRNAの遺伝暗号表
※生物種によっては，以下の普遍暗号に従わないコドンを持つ場合もある。

		第２文字
		U		C		A		G
第 １ 文 字	U	UUU	Phe／F	UCU	Ser／S	UAU	Tyr／Y	UGU	Cys／C	U	第 ３ 文 字
		UUC	Phe／F	UCC	Ser／S	UAC	Tyr／Y	UGC	Cys／C	C
		UUA	Leu／L	UCA	Ser／S	UAA	終了	UGA	終了	A
		UUG	Leu／L	UCG	Ser／S	UAG	終了	UGG	Trp／W	G
	C	CUU	Leu／L	CCU	Pro／P	CAU	His／H	CGU	Arg／R	U
		CUC	Leu／L	CCC	Pro／P	CAC	His／H	CGC	Arg／R	C
		CUA	Leu／L	CCA	Pro／P	CAA	Gln／Q	CGA	Arg／R	A
		CUG	Leu／L	CCG	Pro／P	CAG	Gln／Q	CGG	Arg／R	G
	A	AUU	Ile／I	ACU	Thr／T	AAU	Asn／N	AGU	Ser／S	U
		AUC	Ile／I	ACC	Thr／T	AAC	Asn／N	AGC	Ser／S	C
		AUA	Ile／I	ACA	Thr／T	AAA	Lys／K	AGA	Arg／R	A
		AUG	Met／M（開始）	ACG	Thr／T	AAG	Lys／K	AGG	Arg／R	G
	G	GUU	Val／V	GCU	Ala／A	GAU	Asp／D	GGU	Gly／G	U
		GUC	Val／V	GCC	Ala／A	GAC	Asp／D	GGC	Gly／G	C
		GUA	Val／V	GCA	Ala／A	GAA	Glu／E	GGA	Gly／G	A
		GUG	Val／V	GCG	Ala／A	GAG	Glu／E	GGG	Gly／G	G

DNAの遺伝暗号表

		第２文字
		T		C		A		G
第 １ 文 字	T	TTT	Phe／F	TCT	Ser／S	TAT	Tyr／Y	TGT	Cys／C	T	第 ３ 文 字
		TTC	Phe／F	TCC	Ser／S	TAC	Tyr／Y	TGC	Cys／C	C
		TTA	Leu／L	TCA	Ser／S	TAA	終了	TGA	終了	A
		TTG	Leu／L	TCG	Ser／S	TAG	終了	TGG	Trp／W	G
	C	CTT	Leu／L	CCT	Pro／P	CAT	His／H	CGT	Arg／R	T
		CTC	Leu／L	CCC	Pro／P	CAC	His／H	CGC	Arg／R	C
		CTA	Leu／L	CCA	Pro／P	CAA	Gln／Q	CGA	Arg／R	A
		CTG	Leu／L	CCG	Pro／P	CAG	Gln／Q	CGG	Arg／R	G
	A	ATT	Ile／I	ACT	Thr／T	AAT	Asn／N	AGT	Ser／S	T
		ATC	Ile／I	ACC	Thr／T	AAC	Asn／N	AGC	Ser／S	C
		ATA	Ile／I	ACA	Thr／T	AAA	Lys／K	AGA	Arg／R	A
		ATG	Met／M（開始）	ACG	Thr／T	AAG	Lys／K	AGG	Arg／R	G
	G	GTT	Val／V	GCT	Ala／A	GAT	Asp／D	GGT	Gly／G	T
		GTC	Val／V	GCC	Ala／A	GAC	Asp／D	GGC	Gly／G	C
		GTA	Val／V	GCA	Ala／A	GAA	Glu／E	GGA	Gly／G	A
		GTG	Val／V	GCG	Ala／A	GAG	Glu／E	GGG	Gly／G	G

コドン解明のきっかけとなった実験に関連して
※初期表示はmRNA（UUUUUUUUUUUU），ポリペプチドはα-helix構造で組み立て
※mol形式のポリペプチドはProtein選択やそれに関する特殊表示は不可

実験者名 mRNA（部分） ポリペプチド（部分） ニーレンバーグ UUUUUUUUUUUU　 FFFF　（PDB形式）｜ （mol形式） コラーナ CACACACACACA　 HTHT　（PDB形式）｜ （mol形式） その他の参考データ（PDB部分データリストより） PDB_1g59のChain A・B（tRNAGluとGluRSの複合体） PDB_1asyのChain A・R（tRNAAspとAspRSの複合体） PDB_1ml5のChain B・C（P-site tRNAPheとA- and P-site mRNA codons） PDB_1gixのChain B・C・1（A-siteおよびP-site tRNAPheとA- and P-site mRNA codons） PDB_1wz2のChain A・C ｜ PDB_2bytのChain A・B　※理研資料参照 ◆tRNA擬態タンパク質（図３参照） PDB_1eh1のChain A（図3のRRF） PDB_1dt9のChain A（図3のeRF1） PDB_1darのChain A（図3のEF-G） PDB_1tttのChain A・D（図3のEF-Tu tRNA 複合体） PDB_1gqeのChain A（図3のRF2）　 Ser205・Pro206・Phe207選択

Backbone 2oStructure Termini DNA/RNA（ATGCU） Ligands表示 OFF Water表示（*印データのみ）　 OFF 全選択 Ligand選択 Protein選択 DNA/RNA全選択 同backbone選択 空間充填 球棒 スティック OFF CPK amino ｜ ラベル表示 OFF 酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 極性・非極性区別 有機概念図I/O値順（特性基 R）| 同（アミノ酸） 等電点順 Dot Surface表示 OFF 水素結合（細） 同（太） OFF Specular OFF ｜ 光量30% OFF 背景・黒 背景・灰 背景・白 回転 OFF ｜ 画像をクリップボードへコピー ※amino表示の凡例 ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO ＝ 以下の表示はアミノ酸の親水性・疎水性参照 ＝ ※酸性・中性〈芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例 ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS ※極性〈酸性・塩基性〉・非極性（疎水性）アミノ酸区別 SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP ※有機概念図I/O値順（特性基 R） ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE ※同上（アミノ酸） GLY　SER　ASN　ASP　GLN　THR　GLU　ALA　ARG　HIS VAL　LYS　CYS　PRO　LEU　TYR　ILE　MET　TRP　PHE ※等電点順 ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

※文献や最近の話題などはJmol版に移動しました！