・Select / Display List / Generate Surface → Select / Display List / Color / Electrostatic Potential / Rasmol potential
・Select / Display List / Generate Surface → Select / Display List / Color / Molecular Lipophilicity Potential / Color MLP

※結合の手の数（原子価）

●上記の操作による表示画像例（以下は画像で，分子回転などはできません）

　メタンが安定な正四面体型をしているのに対し，アンモニアは平面ではなく“三脚型”，水は直線構造ではなく“ベント型”をしています．
　実は上図下段のモデルに示したように，アンモニアには１組の，水には２組の非結合電子対（孤立電子対ともいう；ピンク色で表示）が存在し，それらを含めて考えるとアンモニアも水も，メタンの正四面体構造に似通った対称性の高い四面体をしていることがわかります（これらは何れも，「化学」で習う sp³ 混成オービタルに基づいています）．これらの非結合電子対の有無が，分子の性質に大きな関与をしているのです．
　分子のかたちの対称性が重要であることは，『群論』という数学的手法を用いて詳しく考察されています．

参考文献・ホームページ
• 大岩正芳，「群論と分子」，化学同人(1969)
• 西本吉助・今村詮 編，山口兆・山辺信一・北浦和夫 著，「分子設計のための量子化学」，講談社サイエンティフィク(1989)
• R.A.Alberty 著，妹尾学・黒田晴雄 訳 ，「物理化学（上）」，東京化学同人(1991)
• B.C.Webster 著，小林宏・松沢英世 訳，「原子と分子　−化学結合の基本的理解のために−」，化学同人(1993)
• 関崎正夫，『化学基礎講座　対称とその化学への応用』，現代化学，1997年10号〜，東京化学同人
• Molecular Shape（Molecules from Chemistry at Okanagan University College）

• 水，アンモニア，メタン，二酸化炭素
• 結合の種類の例（アミノ酸を例に）
• 生体分子の水素結合
• 本間善夫・川端潤，「パソコンで見る動く分子事典」，p.18，講談社ブルーバックス(1999)