◆ 分子の重ね合わせ(7)/トロンボキサンA2と拮抗剤 ◆
プロスタグランジン分子データ集(Jmol版)

◎山川眞透・江角清志,『定量的構造活性相関とドラッグデザイン』,pp.116-119
… 川田純ほか 編,「化学増刊116 創薬のための分子設計」,化学同人(1989)

※以下の各分子モデルはある初期座標からPM3計算したもので,重ね合わせデータは文献の重ね合わせ図(p.118,図3)を参考にして選んだ3原子を指定して作成した。

参考:複合分子と分子の重ね合わせ/分子データの作成方法


空間充填  球棒モデル  OFF
Electrostatic Potential  Lipophilic Potential

TXA2(thromboxane A2
血管収縮作用,血小板凝集作用


空間充填  球棒モデル  OFF
Electrostatic Potential  Lipophilic Potential

sulotroban
TXA2の拮抗剤(非プロスタノイド系)


空間充填  球棒モデル  OFF
Electrostatic Potential  Lipophilic Potential

S-145
TXA2の受容体拮抗剤


球棒モデル  空間充填  OFF(スティック)
色分け1  色分け2  OFF(CPK)
初期化(色分け1で重ね合わせ元原子を球棒)
色分け1でTXA2を球棒  色分け1でsulotrobanを球棒  色分け1でS-145を球棒

TXA2,sulotroban,S-145の重ね合わせ例

・色分け1(Chain):赤がTXA2,青がsulotroban,緑がS-145
・色分け2(Group):主にグループ(置換基)で色分け



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