◆ 抗がん剤開発と標的タンパク質 ◆
= 分散コンピューティングによるがんの新薬開発 =

Jmol版話題の制がん剤・抗がん剤


グリッドコンピューティングによる抗がん剤候補探索で用いられたタンパク質
※初期表示はイマチニブ(商品名グリベック)を含む1iepのChain A
PDBsumにより PDB ID または 物質名検索 で LIGPLOT情報参照可(作例集参照)。
CASTpにより,PDB ID 検索あるいはキーワード( cancer など)検索でポケット部位探索可能

821pRAS proteins
1agwのChain A 《Fibroblast Growth Factor Receptor
1aq1CDK-2リガンド結合部位
1bzhProtein-Tyrosine-Phosphatase 1B
1c1yRAF
1c25Catalytic Domain of Cell Cycle Control Phosphatase (Cdc25A)
1d8dFarnesyltransferase
1e7u;ワートマニン(wortmannin) 《Phosphatidylinositol 3 Kinase
1fgiのChain A 《Fibroblast growth factor receptor-1
1fltVascular Endothelial Growth Factor / VEGFr1
1g6hBRAF: ADP-Binding transport protein
1h9oPhosphatidylinositol 3 Kinase (alpha)*
1iepのChain A;イマチニブ(商品名グリベック) 《C-ABL Tyrosine Kinase
1isaのChain A 《Superoxide dismutase*(Fe近接1分子)
1l3eのModel 1 《Hypoxia-inducible factor (HIF-1)
1m17;エルロチニブ 《Epidermal growth factor receptor
1nvsChk1
1o6kProtein Kinase B (AKT-2)
1qb0Catalytic Domain of Cell Cycle Control Phosphatase (Cdc25B)
1rv1Human Double Minute 2 (HDM2) with inhibitor*
1sqoUrokinase plasminogen activator (uPA)
2srcC-SRC Kinase
1t69Histone deacetylase (HDAC)
1t73Androgen receptor (AR)
1t76Androgen receptor (AR) ※1t74,1t79,1t7f,1t7m,1t7r,1t7tは略
1uouThymidine Phosphorylase
1v8kKinesin Kif2C*
1w22のChain A 《Histone deacetylase (HDAC)*
1xjdProtein Kinase C Θ
1ycrHuman Double Minute 2 (HDM2) bound to p53
1yet;ゲルダナマイシン 《Heat Shock Protein 90 (Hsp90)

 Screensaver Lifesaverで用いられた標的タンパク質
 Find-a-Drug: Projects - Cancerで用いられたタンパク質
タンパク質バックボーン 同・二次構造 | DNA/RNA(ATGCU
リガンド表示 OFF 水分子表示(*印データのみ)  OFF
全選択 リガンド選択 | タンパク質選択 | DNA/RNA全選択 同・糖&リン酸選択
空間充填 球棒 スティック OFF 原子色(CPK) amino色 chain色
ラベル表示(アミノ酸) OFF ドット表面表示 OFF 光沢表示 OFF
水素結合(細) 同(太) OFF シスチン結合(太) OFF S原子(アミノ酸中)空間充填
静電ポテンシャル 同(透明) OFF 親油ポテンシャル 同(透明) OFF
背景・黒 背景・灰 背景・白 | 回転 OFF 画像をクリップボードへコピー

酸性・中性・塩基性アミノ酸区別 | 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 | log P値順 | 等電点順

《 一部のデータではポテンシャル表示時にエラーになります 》
※amino色表示の凡例
ASP GLU CYS MET LYS ARG SER THR PHE TYR
ASN GLN GLY LEU VAL ILE ALA TRP HIS PRO

酸性中性芳香族〉・塩基性アミノ酸区別表示の凡例
ASP GLU GLY ALA VAL LEU ILE CYS SER THR
ASN GLN PRO MET
 PHE TYR TRP LYS ARG HIS

極性酸性塩基性〉・非極性(疎水性)アミノ酸区別
SER THR TYR CYS ASN GLN ASP GLU LYS ARG
HIS
 GLY ALA VAL LEU ILE PHE PRO MET TRP

※hydropathy index順
ARG LYS ASN ASP GLN GLU HIS PRO TYR TRP
SER THR GLY
 ALA MET CYS PHE LEU VAL ILE

※log P値順
GLY SER ASN ASP GLN THR GLU ALA ARG HIS
VAL LYS
 CYS PRO LEU TYR ILE MET TRP PHE

※等電点順
ASP GLU CYS ASN PHE GLN TYR SER MET TRP
VAL GLY LEU
 ALA ILE THR PRO HIS LYS ARG



「生活環境化学の部屋」ホームページ「分子の形と性質」学習帳話題の制がん剤・抗がん剤