元素・分子が登場する本たち！

◆ 元素・分子が登場する本たち！ ◆
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《初期表示はペラミビル（peramivir）》

【1】松岡圭祐，「水鏡推理〈７〉ソヴリン・メディスン」，角川文庫(2025)　→ 出版社ページ
p.7ほかコロナ／COVID-19／新型コロナウイルス感染症：　→ 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2｜COVID-19）情報
p.195 ペラミビル：ペラミビル（peramivir）
p.195 抗インフルエンザ薬：　→ 鳥インフルエンザ＆新型インフルエンザ情報
p.237 ACE2とスパイクタンパク質の結合：7mjm（SARS-CoV-2のスパイク糖タンパク質イギリス型B.1.1.7変異（アルファ株），ヒトACE2との結合体；N501Y変異含む）
p.237 TMPRSS2阻害剤：7meq（阻害剤例ナファモスタット〈nafamostat〉結合型が結合したヒトTMPRSS2構造）　同PDBsumデータ7meq_GBS$ ｜ナファモスタット（nafamostat）

バックボーン　二次構造｜ DNA/RNA（ATGCU，backbone）
全選択　タンパク質選択　DNA/RNA選択　同backbone選択　リガンド選択　HB選択（$印のみ）　（*印のみ）
空間充填　球棒　球10％　球25％　球30％　球60％　スティック　スティック（太）　針金
アミノ色　Chain色　CPK色　∥　Jmol色　Rasmol色 ∥ 濃赤　濃青　緑　ピンク　濃ピンク　橙　紫　青
糖鎖別着色（#印のみ）：Gal，α-Glc，β-Glc，Man，Fuc，Xyl，Sia，GalNAc，GlcNAc，GlcA ∥ Asn,Ser,Thr選択｜ Asn　Ser　Thr
酸性・中性・塩基性区別　極性・非極性区別　疎水性インデックス順　I/O値順（特性基 R）　等電点順　コンホメーション選択性（αヘリックス・βストランド）
水素結合表示｜ S-S結合表示　
　　
背景・黒　灰　白　紺
　Chain選択： A B C D E F G H I J K L M N O P

ASP　GLU　CYS　MET　LYS　ARG　SER　THR　PHE　TYR　ASN　GLN　GLY　LEU　VAL　ILE　ALA　TRP　HIS　PRO

酸性

中性

芳香族

塩基性

ASP　GLU　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　CYS　SER　THR　ASN　GLN　PRO　MET　PHE　TYR　TRP　LYS　ARG　HIS

極性

酸性

塩基性

非極性（疎水性）

SER　THR　TYR　CYS　ASN　GLN　ASP　GLU　LYS　ARG　HIS　GLY　ALA　VAL　LEU　ILE　PHE　PRO　MET　TRP

ARG　LYS　ASN　ASP　GLN　GLU　HIS　PRO　TYR　TRP　SER　THR　GLY　ALA　MET　CYS　PHE　LEU　VAL　ILE

ASN　SER　ASP　GLN　GLU　THR　ARG　HIS　GLY　LYS　TYR　TRP　CYS　MET　PRO　PHE　ALA　VAL　LEU　ILE

ASP　GLU　CYS　ASN　PHE　GLN　TYR　SER　MET　TRP　VAL　GLY　LEU　ALA　ILE　THR　PRO　HIS　LYS　ARG

アミノ酸および特性基の親水性・疎水性

Jmol colors ｜原子・分子とビッグヒストリー

代表的な生体分子： DNA，タンパク質，リン脂質，グルコース，ATP

【1】新型コロナウイルスSARS-CoV-2のプロテアーゼ6lu7

【1】［左］ペラミビル（peramivir）　［中・右］ペラミビルを含む2f10とPDBsumデータ
→ Jmolトピック（ペラミビル関連）

【1】ヒトACE2と結合したイギリス型B.1.1.7変異（アルファ株）SARS-CoV-2スパイク糖タンパク質（N501Y変異含む）7mjm

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「生活環境化学の部屋」ホームページ｜ Jmol版「分子の学習帳」