◆ ペニシリンGを含む生体分子のSITE例 ◆
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※ペニシリンG（penicillin G）： I/O＝1.319


1fxv_PNN（Hydrolase）
I'/O'＝0.993
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺

3huo_PNN（Hydrolase）
I'/O'＝3.000
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺

3kp2_PNN（Transcription regulation/antibiotic）
I'/O'＝2.533
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺

1gm7_PNN（Hydrolase）　※エチレングリコール含む
（I'/O'＝0.994）
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺

1uob_PNNs（Oxidoreductase）　※Fe含む。1uob_PNNからAKGと同HB削除
（I'/O'＝0.898）
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺

1uof_PNN（Oxidoreductase）　※Fe含む
（I'/O'＝1.346）
CPK色　酸性・中性・塩基性　I/O値順
背景・黒　灰　白　紺


ペニシリンGを含むPDBデータ（1FXV）の部分構造から作成した画像例


ペニシリン骨格（上左；下はその一例，ペニシリンG）とD-アラニル-D-アラニンの構造（上右；下はR'がHの場合）の重ね合わせ
※図上の緑色部分が類似部分（構造式は下記文献を若干変えて作成；-COOを-COOHとして表記
◎荻田　健，『講座：微生物と化学(3)／微生物に医薬を探る』，化学と教育，2000年11月号，p.740


川上モデル｜鍵と鍵穴模型


【参考】耐性菌出現の事例／バンコマイシンとアボパルシン
※資料例：バンコマイシン耐性腸球菌感染症（IDWR）

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