◆ モリブデン化合物,タングステン化合物を含む生体分子のSITE例 ◆
生命を知り生命に学ぶPDBsumのLigand-SITE情報と有機性・無機性金属原子を含む生体分子のSITEデータ集

  


モリブデン化合物を含むデータタングステン化合物を含むデータ参考資料

●モリブデン化合物を含むデータ

1ogp_MTQ
I'/O'=1.264
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

1fiq_MTE-MOS(MTE,SAL含む)
[ I'/O'=1.533 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 MOS選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

1g20_CFM*(HCA含む)
[ I'/O'=0.973 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 CFM選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

1n2c_CFM(HCA含む)
[ I'/O'=1.003 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 CFM選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

4tku_ICS*(HCA含む)
[ I'/O'=0.973 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 ICS選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

5ijy_ICS(HCA含む)
[ I'/O'=1.013 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 ICS選択
空間充填 球棒 スティック 消去 Mo球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 
*
鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例参照


1ogp1fiq1g201n2cのモリブデンを含むリガンドのPDBsumデータ


FeMoコファクターを含むニトロゲナーゼ4tku5ijyのPDBsumデータ



1OGPのChain A・B(亜硫酸オキシダーゼ) [Sulfite oxidase - Wikipedia
5IJYのChain A・B(ニトロゲナーゼ) [NEW!] 同PDBsumデータ5ijy_ICS(HCA含む;上掲)$ → 他のニトロゲナーゼ構造例 [Nitrogenase - WikipediaPDBj 今月の分子 026: ニトロゲナーゼ(Nitrogenase)

バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PTT選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合(太) OFF
 
 

背景・黒 灰 白 



アミノ酸および特性基の親水性・疎水性Log Pをポケットに!


●タングステン化合物を含むデータ


1b25_PTT(4Fe-4Sクラスター*含む)
[ I'/O'=1.525 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PTT選択
空間充填 球棒 スティック 消去 W球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

1b4n_PTE(4Fe-4Sクラスター*,グルタル酸含む)
[ I'/O'=1.526 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PTE選択
空間充填 球棒 スティック 消去 W球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

2rb5_WO6(Mg含む)
[ I'/O'=1.600 ]
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 スティック 消去 W球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 

4z12_TEW(Te含む)
I'/O'=1.147
全選択 タンパク質選択 リガンド選択
空間充填 球棒 スティック 消去 W球60%表示
CPK色 酸性・中性・塩基性 I/O値順

背景・黒 灰 白 
*
鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例参照



1B25のChain A(アルデヒドフェレドキシンオキシドレダクターゼ) [Aldehyde ferredoxin oxidoreductase - Wikipedia

バックボーン 二次構造
全選択 タンパク質選択 リガンド選択 PTT選択
空間充填 球棒 球60% スティック 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色

酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別
疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順
コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合(太) OFF
 
 

背景・黒 灰 白 



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