◆ Jmolで見るトピックス分子(Vol.3) ◆
最新版 | 関連:バイオ関連トピックス
※初期表示はバレニクリン

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 → Vol.1(No.1-50)2(No.51-100)
  1. バレニクリン(varenicline) ※禁煙補助剤は酒石酸塩 [Varenicline - Wikipedia] ‖ フルオキセチン(fluoxetine) ※日本では未承認(抗うつ剤の分類参照)
  2. ピリフルキナゾン(pyrifluquinazon)
  3. PDBデータ 2xshのChain A-F(ビフェニルジオキシゲナーゼ;2,6-ジクロロビフェニル含む) | 2xrxのChain A-F(同;ビフェニル含む) [Biphenyl 2,3-dioxygenase - Wikipedia
  4. PDBデータ 3agv#(IgG,RNAアプタマー) [Aptamer - Wikipedia
  5. PDBデータ 1um2のChain A・C(エンドヌクレアーゼ,インテイン) [Endonuclease - WikipediaIntein - Wikipedia
  6. PDBデータ 1ftmのChain A(AMPA型グルタミン酸受容体;AMPAが結合) [AMPA receptor - WikipediaAMPA - Wikipedia
  7. プロストラチン(prostratin) [Prostratin - Wikipedia
  8. PDBデータ 1u8d(リボスイッチ) [Riboswitch - Wikipedia
  9. PDBデータ 3ef7*(透明帯構成タンパク質ZP3) [In vitro fertilisation - WikipediaZona pellucida - WikipediaZP3 - Wikipedia
  10. PDBデータ 3al0(グルタミン・トランスアミドソーム)
  11. PDBデータ 3og7(B-Rafプロテインキナーゼ,阻害剤PLX4032結合) [BRAF (gene) - Wikipedia
  12. PDBデータ 3ok9(HIV-1プロテアーゼ;阻害剤GRL-0519Aが結合,GRL-0519Aは座標2種のうちAのみ) [HIV-1 protease - Wikipedia
  13. パクリタキセル (paclitaxel) ‖ 参考:パクリタキセルを含むPDBデータ例 1jff(チューブリン) 同PDBsumデータ 1jff_TA1$3edlの165量体(Chain ABDFG×33;AFがα-チューブリン,BGがβ-チューブリン,Dがキネシン-13モータードメイン) α炭素のみ(4.00MB) パクリタキセル選択 [Paclitaxel - WikipediaTubulin - Wikipedia
  14. PDBデータ 2xp2(未分化リンパ腫キナーゼ(ALK),クリゾチニブ(PF-02341066)が結合) クリゾチニブ選択 [Anaplastic lymphoma kinase - WikipediaCrizotinib - Wikipedia
  15. PDBデータ 1imx*(インスリン様成長因子,IGF-1) [Insulin-like growth factor - Wikipedia
  16. カプトン(Kapton;ポリイミドの例) [Kapton - WikipediaPolyimide - Wikipedia
  17. PDBデータ 2xkk*(トポイソメラーゼ;アシネトバクター・バウマニ由来〈A・C鎖〉,モキシフロキサシン 含む) [Acinetobacter baumannii - WikipediaTopoisomerase - WikipediaMoxifloxacin - Wikipedia
  18. CS-8958(ラニナミビル,laninamivir) [Laninamivir - Wikipedia
  19. PDBデータ 9icd(イソクエン酸脱水素酵素;2量体) [Isocitrate dehydrogenase - Wikipedia
  20. PDBデータ 3m6g(アクチン;lobophorolide 含む)
  21. ムギネ酸(mugineic acid)
  22. PDBデータ 3hvt(HIV-1逆転写酵素;阻害剤ネビラピン nevirapine 含む) [Reverse transcriptase - WikipediaNevirapine - Wikipedia
  23. PDBデータ 3n45(ファルネシルピロリン酸合成酵素;阻害剤含む2量体/阻害剤はFBS_04とビスホスホネート系のゾレドロネート)
  24. 酢酸ウリプリスタル(ulipristal acetate,ella) [Ulipristal acetate - Wikipedia
  25. PDBデータ 3adb(tRNASec・PSTK複合体) selenocysteine選択 [Selenocysteine - Wikipedia
  26. ビタミンK2〈メナキノン〉の例;メナキノン-6 [Vitamin K - Wikipedia
  27. アンブロキサン(ambroxane)
  28. PDBデータ 3bes#(インターフェロンγ〈L鎖〉とエクトロメリアウイルスのインターフェロンγ結合タンパク質〈R鎖〉の複合体) | 同8量体(Chain L・R×4)# [Interferon - Wikipedia
  29. PDBデータ 3ah8(Gタンパク質とYM-254890複合体) Y鎖(YM-254890)選択 YM-254890のみ表示 [G protein-coupled receptor - Wikipedia
  30. PDBデータ 3ngb#(HIV-1 gp120+抗体VRC01) | 同Chain A-C#
  31. PDBデータ 3l1e(クリスタリン;2量体) [Crystallin - Wikipedia
  32. ブチルブチレート(butyl butyrate;酪酸ブチル,ブタン酸ブチル) [Butyl butyrate - Wikipedia] | 2-メチルブタノール(2-methylbutanol;異性体あり) [2-Methyl-1-butanol - Wikipedia
  33. オセルタミビル(リン酸塩が商品名タミフル) | 17β-エストラジオール(天然エストロゲンの例) | エチニルエストラジオール(合成エストロゲンの例) | イブプロフェン(抗炎症薬) | カルバマゼピン(抗てんかん剤)
  34. PDBデータ 3mfi(DNAポリメラーゼη〔Polη〕;タンパク質A鎖は座標2種のうちAのみ) 同PDBsumデータ 3mfi_DTP$(dATP+チミン二量体+DOC) cis-syn チミン-チミン(T-T)二量体選択 [DNA polymerase - Wikipedia
  35. Liイオン内包フラーレンC60(Li@C60) [Fullerene - Wikipedia
  36. アログリプチン(alogliptin) [Alogliptin - Wikipedia
  37. ラベプラゾールナトリウム(sodium rabeprazole) | ラベプラゾール [Rabeprazole - Wikipedia
  38. PDBデータ 2zm8(ナイロンオリゴマー分解酵素;解像度は1.55Å) 同PDBsumデータ 2zm8_ACA2(ナイロン6ダイマー)$ ナイロン6ダイマー選択
  39. PDBデータ 1yy9#(EGF受容体;セツキシマブ〔cetuximab〕含む) C・D鎖(Cetuximab Fab)選択 [Epidermal growth factor receptor - WikipediaCetuximab - Wikipedia
  40. PDBデータ 1fpv(パルボウイルス,ネコ汎白血球減少症ウイルス) 60量体 α炭素のみ(1.83MB)
  41. PDBデータ 3aeq*(光非依存性プロトクロロフィリド還元酵素) [Protochlorophyllide reductase - Wikipedia
  42. ピラセタム(piracetam) [Piracetam - Wikipedia] | メチルフェニデート(methylphenidate;塩酸塩がリタリン) [Methylphenidate - Wikipedia
  43. フェネチルアミン(phenethylamine) [Phenethylamine - Wikipedia
  44. PDBデータ 1cvn#(コンカナバリンA) | 同Chain A# [今月の分子 2010/04(PDBj)Concanavalin A - Wikipedia
  45. ラメルテオン(ramelteon) [Ramelteon - Wikipedia
  46. (R)-リナロール | (S)-リナロール [Linalool - Wikipedia
  47. PDBデータ 2zxo
  48. ビタミンB1(vitamin B1;チアミン thiamine) [Thiamine - Wikipedia
  49. アドレナリン → 脳内物質例(抗うつ剤の分類 内)グルタミン酸ナトリウム(グルタミン酸モノナトリウム) 20種類のアミノ酸セルロース(レーヨンはセルロース繊維の一種)〈セロビオース単位〉 → 代表的な高分子
  50. アトルバスタチン(atorvastatin)| アトルバスタチンを含むPDBデータ 1hwkのChain A・B 同PDBsumデータ 1hwk_117$ドネペジル(donepezil;塩酸ドネペジルが商品名アリセプト Aricept)


バックボーン 二次構造 | DNA/RNA(ATGCUbackbone
全選択 タンパク質選択 DNA/RNA選択 同backbone選択 リガンド選択 HB選択($印のみ) (*印のみ)
空間充填 球棒 球10% 球25% 球30% 球60% スティック スティック(太) 針金
アミノ色 Chain色 CPK色 ‖ Jmol色 Rasmol色 ‖ 濃赤 濃青  ピンク 濃ピンク   
糖鎖別着色(#印のみ)GalGlcManFucXylSiaGalNAcGlcNAcGlcAAsn,Ser,Thr選択 | Asn Ser Thr
酸性・中性・塩基性区別 極性・非極性区別 疎水性インデックス順 I/O値順(特性基 R) 等電点順 コンホメーション選択性(αヘリックスβストランド
水素結合表示S-S結合表示   背景・黒 灰 白 
 Chain選択: A B C D E F G H I J K L M N O P Q R



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