GPCR関連最新ニュース ※“上掲”はJmolページ で表示
Cryo-EM structure of activated bile acids receptor TGR5 in complex with stimulatory G protein(Signal Transduction and Targeted Therapy,2020/08/03) [NEW!] ※2020/09/02公開PDBデータ7bw0(上掲)
Structural insights into the activation of GLP-1R by a small molecule agonist(Cell Research,2020/07/28) [NEW!] ※2020/08/26公開PDBデータ7c2e(上掲)
RCSB PDB 2020/08/12新規公開データより:6wzg Human secretin receptor Gs complex [NEW!] ※他に6wi9 公開
Structural insights into differences in G protein activation by family A and family B GPCRs(Science,2020/07/31) [NEW!] ※2020/08/12公開PDBデータ6wpw(上掲)
Structures of metabotropic GABAB receptor(Nature,2020/07/24) [NEW!] ※2020/07/01公開PDBデータ6w2x(ヘテロダイマー)・6w2y(ホモダイマー,上掲)
Crystal structure of the human oxytocin receptor(Science Advances,2020/07/15) [NEW!] ※2020/08/05公開PDBデータ6tpk(上掲) → オキシトシン(本サイト)
Structural insights into probe-dependent positive allosterism of the GLP-1 receptor(Nature Chemical Biology,2020/07/20) [NEW!] ※2020/07/29公開PDBデータ7c61(5-HT1B 受容体;こちらのみ上掲)・7c6a(アンジオテンシン受容体 AT2 R)
→ 他のエルゴタミン結合セロトニン受容体のPDBsumデータ画像
Structural insights into probe-dependent positive allosterism of the GLP-1 receptor(Nature Chemical Biology,2020/07/20) [NEW!] ※2020/07/22公開PDBデータ6vcb(上掲)
RCSB PDB 2020/07/15新規公開データより:6s0q Structure of the A2A adenosine receptor determined at SwissFEL using native-SAD at 4.57 keV from 50,000 diffraction patterns [NEW!] ※他に6s0l公開
PDBsumデータ画像は別ページ
Structure-based development of a subtype-selective orexin 1 receptor antagonist(PNAS,2020/07/15) [NEW!] 2020/07/15公開データ6v9s
RCSB PDB 2020/07/08新規公開データより:6wjc Muscarinic acetylcholine receptor 1 - muscarinic toxin 7 complex [NEW!]
RCSB PDB 2020/07/01新規公開データより:6pgs Crystal structure of bovine opsin with geraniol bound [NEW!] ※他に6ph7公開
Structure of human GABAB receptor in an inactive state(Nature,2020/06/24) [NEW!] ※2020/07/01公開PDBデータ6wiv(上掲)
Structural basis of the activation of a metabotropic GABA receptor(Nature,2020/06/17) [NEW!] ※2020/06/10公開PDBデータ6uo8(上掲)・6uo9・6uoa・6vjm
Structural basis for chemokine receptor CCR6 activation by the endogenous protein ligand CCL20(Nature Communications,2020/06/15) [NEW!] ※2020/06/24公開PDBデータ6wwz(上掲)
Molecular determinants of β-arrestin coupling to formoterol-bound -adrenoceptor(Nature,2020/06/11) [NEW!] ※2020/06/17公開PDBデータ6vms(上掲)
Molecular determinants of β-arrestin coupling to formoterol-bound ββ1 -adrenoceptor(Nature,2020/06/17) [NEW!] ※2020/06/17公開PDBデータ6tko(上掲)
右端図は下掲別論文
Determination of the melanocortin-4 receptor structure identifies Ca2+ as a cofactor for ligand binding(Science,2020/04/24) ※2020/04/29公開PDBデータ6w25(上掲)
Activation of the α2B adrenoceptor by the sedative sympatholytic dexmedetomidine(Nature Chemical Biology,2020/03/09) ※2020/04/15公開PDBデータ6k41(上掲)・6k42
Advances in therapeutic peptides targeting G protein-coupled receptors(Nature Reviews Drug Discovery,2020/03/19)
Nanobody-enabled monitoring of kappa opioid receptor states(Nature Communications,2020/03/02) ※2020/03/18公開PDBデータ6vi4(上掲)
Cryo-EM structure of the human PAC1 receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein(Nature Structural & Molecular Biology,2020/03/09) ※2020/03/11公開PDBデータ6lpb(上掲)
Haloperidol bound D2 dopamine receptor structure inspired the discovery of subtype selective ligands(Nature Communications,2020/02/26) ※2020/03/04公開PDBデータ6luq(上掲)
構造生物学:アレスチン複合体を捕捉する(Nature ハイライト,2020/03/12) ※下記2論文紹介
Structural basis of ligand recognition and self-activation of orphan GPR52(Nature,2020/02/19) ※2020/02/26公開PDBデータ6li0(上掲)・6li1・6li2・6li3
Angiotensin and biased analogs induce structurally distinct active conformations within a GPCR(Science,2020/02/21) ※2020/02/20公開データ6os0・6os1・6os2(上掲)
Gタンパク質共役型β2アドレナリン受容体がシグナル伝達活性を発揮する状態における構造を可視化(日本医療研究開発機構,2020/02/17) ※2020/01/29公開PDBデータ6kr8(上掲)
Activation and Signaling Mechanism Revealed by Cannabinoid Receptor-Gi Complex Structures(Cell,2020/01/30) ※2020/02/13公開PDBデータ6kpc(上掲)・6kpf・6kpg,リガンドは共通。
Cryo-EM Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB2-Gi Signaling Complex(Cell,2020/01/30) ※2020/02/13公開PDBデータ6pt0(上掲;画像は上記記事に並べて)
Toward a Structural Understanding of Class B GPCR Peptide Binding and Activation(Molecular Cell,2020/01/30) ※2020/02/05公開PDBデータ6p9x(副腎皮質刺激ホルモン放出因子受容体,上掲)・6p9y(下垂体アデニル酸シクラーゼ活性化ペプチド受容体,掲載略)
構造生物学:糖尿病治療標的に結合した小分子(Nature ハイライト,2020/01/16) ※“2型糖尿病の経口投与薬候補である小分子TT-OAD2と複合体を形成したGLP-1RおよびそのGタンパク質の構造”
The Crystal Structure of Angiotensin II Type 2 Receptor with Endogenous Peptide Hormone(Structure,2019/12/30) ※2020/01/15公開PDBデータ6jod(上掲)
Structural basis of ligand selectivity and disease mutations in cysteinyl leukotriene receptors(Journal of Medicinal Chemistry,2019/12/20) ※2020/01/01公開PDBデータ6to7(上掲)・6tod・6tp3・6tp4・6tp6・6tq4・6tq6・6tq7・6tq9(以上OX1 )および6tpg・6tpj(上掲)・6tpn(以上OX2 ),加えて2020/01/15公開データ(OX1 )6tos・6tot(上掲)
Structural basis of ligand selectivity and disease mutations in cysteinyl leukotriene receptors(Nature Communications,2019/12/06) ※2019/12/11公開PDBデータ6rz6・6rz7・6rz8・6rz9(上掲)
Structural Basis of the Diversity of Adrenergic Receptors(Cell Reports,2019/12/03) ※2019/12/04公開PDBデータ6kux(上掲)・6kuy
Crystal structure of dopamine receptor D4 bound to the subtype selective ligand, L745870(Elife,2019/11/21) ※2019/12/04公開PDBデータ6iql(上掲)
Structure of an endosomal signaling GPCR-G protein-β-arrestin megacomplex(Nature Structural & Molecular Biology,2019/11/18) ※2019/11/20公開PDBデータ6ni3(上掲)
Toward G protein-coupled receptor structure-based drug design using X-ray lasers(IUCrJ,2019/10/24) ※2019/11/13公開PDBデータ6prz〜6ps6(β2 アドレナリン受容体,6ps3を上掲)・6ps7(アデノシンA2A 受容体,上掲)・6ps8(メラトニン受容体MT1 ,上掲)
High-viscosity sample-injection device for serial femtosecond crystallography at atmospheric pressure(Journal of Applied Crystallography,2019/10/22) ※2019/10/30公開PDBデータ6jzh(上掲)
Structure-based mechanism of cysteinyl leukotriene receptor inhibition by antiasthmatic drugs(Science Advances,2019/10/09) ※2019/10/30公開PDBデータ6rz4・6rz5(上掲)
Structure of an allosteric modulator bound to the CB1 cannabinoid receptor(Nature Chemical Biology,2019/10/28) ※2019/10/23公開PDBデータ6kqi(上掲)
RCSB PDB 2019/10/09新規公開データより(上掲):6gux Dark-adapted structure of Archaerhodopsin-3 at 100K ※他に6guy・6guz公開
A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators(PNAS,2019/09/23) ※2019/10/02公開PDBデータ6jo0
新型の光応答性タンパク質であるヘリオロドプシンの構造を解明(JST,2019/09/26) ※2019/09/25公開PDBデータ6is6 → Jmolトピック
RCSB PDB 2019/08/14新規公開データより(上掲):6rnk Crystal structure of a humanized (K18E,succinate receptor SUCNR1 (GPR91) in complex with a nanobody and antagonist NF-56-EJ40 ※他に6ibb公開
Crystal structure of human endothelin ETB receptor in complex with peptide inverse agonist IRL2500(Communications Biology,2019/06/21) ※2019/07/17公開データ6k1q
細胞生物学:Smoothenedを介するシグナル伝達(Nature ハイライト,2019/07/11)
Conformational transitions of a neurotensin receptor 1-Gi1 complex(Nature,2019/06/26) ※2019/07/10新規公開データ6os9(完全活性化状態)・6osa(中間体状態,上掲)
RCSB PDB 2019/06/26新規公開データより(上掲):6n48 Structure of beta2 adrenergic receptor bound to BI167107, Nanobody 6B9, and a positive allosteric modulator
Structural Insights into the Process of GPCR-G Protein Complex Formation(Cell,2019/05/16) ※2019/06/05公開データ6e67(上掲;他に6eg8公開);リガンドは上記記事と同じBI-167107(以下にPDBsumデータ比較図)
RCSB PDB 2019/05/08新規公開データより:6oij Muscarinic acetylcholine receptor 1-G11 protein complex ※他に6oik 公開(何れも上掲)
構造生物学:分子レベルでの不眠症治療薬の設計(Nature ハイライト,2019/05/09)
High-viscosity injector-based Pink Beam Serial Crystallography of Micro-crystals at a Synchrotron Radiation Source(IUCrJ,2019/04/05) ※2019/04/24公開データ6mh8(上掲)
構造生物学: ついに明らかになったクラスC GPCRの構造(Nature ハイライト,2019/02/07)
統合失調症やパーキンソン病の治療薬の標的の構造解明 −副作用を抑えた薬の合理的な探索・設計が可能に−(京都大学,2019/02/05) ※2019/02/13公開データ6a93(リスペリドン結合)・6a94(ゾテピン結合;上掲)
Structure of a Signaling Cannabinoid Receptor 1-G Protein Complex(Cell,2019/01/24) ※2019/01/30公開データ6n4b(上掲)
Distinctive Activation Mechanism for Angiotensin Receptor Revealed by a Synthetic Nanobody(Cell,2019/01/24) ※2019/01/30公開データ6do1(上掲)
Crystal Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB2(Cell,2019/01/24) ※2019/01/30公開データ5zty(上掲)
Structural basis for ligand recognition of the human thromboxane A2 receptor(Nature Chemical Biology,2018/12/03) ※2018/12/19公開データ6iiu(ラマトロバン結合;上掲)・6iiv(ダルトロバン結合)
多くの創薬標的受容体(GPCR)を耐熱化する共通の方法を発見 −GPCRを標的とした創薬研究に大きく貢献−(京都大学,2018/12/14) ※“2本の論文として、2018年11月12日および12月3日に、国際学術誌「Nature Chemical Biology」のオンライン版に掲載”。
シグナル伝達に関わる三量体Gタンパク質が細胞膜を離れて細胞質にとどまる仕組みを原子レベルで解明(SPring-8,2018/11/22) ※2018/10/17公開5z1n(上掲)・5z39
Structural insights into the subtype-selective antagonist binding to the M2 muscarinic receptor(Nature Chemical Biology,2018/11/12) ※2018/11/14公開データ“5ZK8 (M2-BRIL−NMS), 5ZKC (S110R-BRIL−NMS), 5ZKB (S110R-BRIL−AF-DX 384), 5ZK3 (S110R-BRIL−QNB), 5YC8 (S110R-BRIL−NMS:Hg)”;5yc8を上掲
Structure-guided development of selective M3 muscarinic acetylcholine receptor antagonists(PNAS,2018/11/07) ※2018/11/28公開5zhp(上掲)
Crystal structures of human ETB receptor provide mechanistic insight into receptor activation and partial activationr(Nature Communications,2018/11/08) ※2018/11/14公開データ“6IGK (ET3-bound) and 6IGL (IRL1620-bound)”;6iglを上掲
Structural insights into binding specificity, efficacy and bias of a β2 AR partial agonist(Nature Chemical Biology,2018/10/26) ※2018/11/14公開データ6mxt(上掲)
Molecular basis for high affinity agonist binding in GPCRs(Science,2019/05/24) [PDF] ※2018/10/17公開データ6h7j〜6h7o(6h7nを上掲),2019/01/09公開データ6ibl
Crystal structure of rhodopsin in complex with a mini-Go sheds light on the principles of G protein selectivity(Science Advances,2018/09/19) ※2018/10/03公開データ6fuf(上掲)
構造生物学: 片頭痛に関係するCGRP受容体の構造がついに明らかになった(Nature ハイライト,2018/09/27) ※2018/09/19公開データ6e3y(上掲)
細胞膜の受容体1分子の動きから薬効を評価 −活性化したGPCR分子の動きは遅くなる−(理研,2018/09/19) ※“本研究成果は、1分子レベルで薬の作用機序を理解する1分子薬理学の発展や、1分子イメージングを用いたGPCR標的化合物の薬効評価という新たなドラッグスクリーニング手法の開発に貢献すると期待できます”。
新しいオピオイド鎮痛薬の開発(和歌山県立医科大学,2018/09/06) → Jmolトピック
GPCRシグナル伝達の複雑な話(Nature ダイジェスト,2018/09) ※“全薬剤の約3分の1は、Gタンパク質共役受容体(GPCR)1と呼ばれるタンパク質ファミリーに属する分子を標的としている”。
Structural mechanisms of selectivity and gating in anion channelrhodopsins(Nature,2018/08/29) ※2018/09/05公開データ6csm(上掲)・6csn(上掲)・6cso
構造生物学: Frizzled受容体の構造(Nature ハイライト,2018/08/30) ※2018/08/22公開データ6bd4(上掲)
Structural determinants of 5-HT2B receptor activation and biased agonism(Nature Structural & Molecular Biology,2018/08/20) ※2018/08/29公開データ6ds0(LY266097結合,上掲);他に6drx(lisuride〈リスリド〉結合)・6dry(methylergonovine〈メチルエルゴメトリン〉結合)・6drz(methysergide〈メチセルジド〉結合)公開
分子の立体構造から血圧調節の仕組みを原子レベルで解明 −高血圧症の新しい治療法の開発へ−(京都大学,2018/07/23) ※2018/07/11公開データ5xjm(上掲)
Cryo-EM structure of human rhodopsin bound to an inhibitory G protein(Nature,2018/06/21) ※2018/06/20公開データ6cmo(上掲)
Cryo-EM structure of the serotonin 5-HT1B receptor coupled to heterotrimeric Go (Nature,2018/06/20) ※2018/06/20公開データ6g79(上掲)
Structure of the adenosine-bound human adenosine A1 receptor−Gi complex(Nature,2018/06/20) ※2018/06/20公開データ6d9h(上掲)
Structure of the μ-opioid receptor−Gi protein complex(Nature,2018/06/13) ※2018/06/13公開データ6dde・6ddf(上掲)
Orthosteric and allosteric action of the C5a receptor antagonists(Nature Structural & Molecular Biology,2018/06/04) ※2018/05/30公開データ6c1q(PMX53とNDT9513727結合)・6c1r(PMX53とavacopan結合;上掲)
Structural Basis of Smoothened Activation in Hedgehog Signaling(Cell,2018/05/24) ※2018/05/23公開データ6d32(上掲)・6d35
Cryo-EM structure of the adenosine A2A receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein(eLife,2018/05/04) ※2018/05/16公開データ6gdg(上掲)
構造生物学: NPY受容体の構造(Nature ハイライト,2018/04/26) ※2018/04/25公開データ5zbh(BMS-193885結合)・5zbq(UR-MK299結合;上掲)
Ligand channel in pharmacologically stabilized rhodopsin(PNAS,2018/03/19) ※上掲6fk6(2018/04/04公開データ,S-RS01結合);他に6fk7 (RS06), 6fk8 (RS08), 6fk9 (RS09), 6fka (RS11), 6fkb (RS13), 6fkc (RS15) ,6fkd (RS16)が同時公開
Study changes long-held concepts of cell decoding(NIH,2018/03/28)
構造生物学: クラスBのGPCR群で見られるバイアス型作用の基盤(Nature ハイライト,2018/03/01) ※上掲6b3j(2018/02/21公開データ)
Structural Connection between Activation Microswitch and Allosteric Sodium Site in GPCR Signaling(Structure,2018/02/06) ※2018/02/21公開データ5wf5 (D52N変異体;上掲)・5wf6 (S91A変異体)
5-HT2C Receptor Structures Reveal the Structural Basis of GPCR Polypharmacology(Cell,2018/02/08) ※2018/02/14公開データ6bqg (エルゴタミン結合)・6bqh (リタンセリン結合;上掲)
Crystal structure of the human 5-HT1B serotonin receptor bound to an inverse agonist(Cell Discovery,2018/03/13) ※上掲5v54(2018/02/07公開データ)
Measuring molecular interactions(ETH Zürich,2018/02/01) ※RCSB PDBのFacebook投稿(2018/03/26) より;上掲4mqt(2013/11/27公開データ)の図掲載
Structure of the D2 dopamine receptor bound to the atypical antipsychotic drug risperidone(Nature,2018/01/24) ※6cm4(2018/03/14公開データ;2018/01/31公開6c38の更新)
Structure of the Nanobody-Stabilized Active State of the Kappa Opioid Receptor(Cell,2018/01/11) ※上掲6b73(2018/01/17公開データ)
Towards high throughput GPCR crystallography: In Meso soaking of Adenosine A2A Receptor crystals(Scientific Reports,2018/01/08) ※上掲5olo(2018/01/17公開データ;同時公開の5olg・5olh・5olv・5olz・5om1・5om4はPDBsumデータのみ掲載)
構造生物学: グルカゴン受容体が作る複合体の構造(Nature ハイライト,2018/01/04) ※上掲5yqz(2018/01/17公開データ)
構造生物学: 補体受容体の構造(Nature ハイライト,2018/01/04) ※上掲5o9h(2018/01/10公開データ)
High-throughput in situ X-ray screening of and data collection from protein crystals at room temperature and under cryogenic conditions(Nature Protocols,2018/01/04) ※上掲5vra・5wkt(2017/12/13公開)
Allosteric Coupling of Drug Binding and Intracellular Signaling in the A2A Adenosine Receptor(Cell,2017/12/28) ※上掲6aqf(2018/01/10公開データ)
ロイコトリエンB4 受容体の構造 −GPCRに対する逆作動薬探索の効率化に向けて−(理研,2018/01/09) ※上掲5x33(2018/01/03公開データ)
G Protein-Coupled Receptors as Targets for Approved Drugs: How Many Targets and How Many Drugs?(Molecular Pharmacology,2018/01/03)
Crystal structures of human orexin 2 receptor bound to the selective antagonist EMPA determined by serial femtosecond crystallography at SACLA(Cell,2017/12/07) [PDF] ※上掲5ws3(2017/12/13公開データ)
Highlighting Structural Biology(RCSB PDB,2017/11/07)
D4 dopamine receptor high-resolution structures enable the discovery of selective agonists(Science,2017/10/20) ※上掲5wiv(2017/10/18公開データ;他に5wiu)
Mechanism of intracellular allosteric β2 AR antagonist revealed by X-ray crystal structure(Nature,2017/08/16) ※上掲5x7d(2017/08/16公開データ)
X-ray structures of endothelin ETB receptor bound to clinical antagonist bosentan and its analog(Nature Structural & Molecular Biology,2017/08/04) ※上掲5x93・5xpr(2017/08/16公開データ)
Structures of Human A1 and A2A Adenosine Receptors with Xanthines Reveal Determinants of Selectivity(Structure,2017/08/01) ※上掲5mzj・5mzp・5n2r・5n2s(2017/07/26公開データ)
Structural insights into the extracellular recognition of the human serotonin 2B receptor by an antibody(PNAS,2017/07/11) ※上掲5tud(2017/07/26公開データ)
Crystal structures of agonist-bound human cannabinoid receptor CB1 (Nature,2017/07/05) ※上掲5xr8・5xra(2017/07/12公開データ)
我々はどうやって青色を見ているのか ?霊長類青センサータンパク質の構造解析(名古屋工業大学,2017/07/10)
Crystal structure of the GLP-1 receptor bound to a peptide agonist(Nature,2017/05/31) ※上掲5nx2(2017/06/14公開データ)
構造生物学: 低温電子顕微鏡法により解かれたGPCRの構造(Nature ハイライト,2017/06/01) ※上掲5uz7(2017/05/03公開データ)
Cryo-EM structure of the activated GLP-1 receptor in complex with a G protein(Nature,2017/05/24) ※上掲5vai(2017/05/24公開データ)
RCSB PDB 2017/05/24 新規公開データより:5uvi Serial Millisecond Crystallography of Membrane and Soluble Protein Micro-crystals using Synchrotron Radiation …アデノシンA2A 受容体
Structural basis for perception of diverse chemical substances by T1r taste receptors(Nature Communications,2017/05/24) ※上掲5x2m(2017/05/24公開データ;他に5x2n・5x2o・5x2p・5x2q) → Jmolトピック に他のPDBsumデータ
Structure of the full-length glucagon class B G-protein-coupled receptor(Nature,2017/05/17) ※上掲5xez・5xf1(2017/05/24公開データ)
Human GLP-1 receptor transmembrane domain structure in complex with allosteric modulators(Nature,2017/05/17) ※上掲5vex(2017/05/17公開データ),5vew(2017/05/24公開データ)
Selectivity determinants of GPCR-G-protein binding(Nature,2017/05/10)
構造生物学: GPCRの新たに見つかった状態(Nature ハイライト,2017/04/20) ※上掲5te3・5te5(2017/04/05公開データ)
Photocyclic behavior of rhodopsin induced by an atypical isomerization mechanism(PNAS,2017/03/13) ※上掲5unf・5ung・5unh(2017/03/15公開データ)
Structure of the Adenosine A1 Receptor Reveals the Basis for Subtype Selectivity(Cell,2017/02/23) ※上掲5uen(2017/03/01公開データ)
A Versatile System for High-Throughput In Situ X-ray Screening and Data Collection of Soluble and Membrane-Protein Crystals(Crystal Growth & Design,2016/10/03) ※上掲5kkh(2017/02/15公開データ)
Crystal Structure of an LSD-Bound Human Serotonin Receptor(Cell,2017/01/26) ※上掲5tvn → Jmolトピック
Crystal structure of the adenosine A2A receptor bound to a novel antagonist reveals a potential allosteric pocket(PNAS,2016/12/29) [PDF] ※上掲5uig
構造生物学: CB1カンナビノイド受容体の構造(Nature ハイライト,2016/12/21) ※上掲5u09
RCSB PDB 2016/12/21 新規公開データより:5b6v A three dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin: resting state structure ※5b6v(光照射前;上掲)・5b6w(光照射後16 ns)・5h2h(40 ns)・5h2i(110 ns)・5h2j(290 ns)・5b6x(760 ns)・5h2k(2 μs)・5h2l(5.25 μs)・5h2m(13.8 μs)・5b6y(36.2 μs;上掲)・5h2n(95.2 μs)・5h2o(250 μs)・5h2p(657 μs)・5b6z(1.725 ms)同時公開
統合失調症における標的分子の新しい生理機能を発見 -細胞内ドパミンD2受容体は新たな創薬標的になる-(東北大学,2016/12/13)
Structure of CC chemokine receptor 2 with orthosteric and allosteric antagonists(Nature Research,2016/12/07) ※上掲5t1a
Intracellular allosteric antagonism of the CCR9 receptor(Nature Research,2016/12/07) ※上掲5lwe
Crystal Structure of the Human Cannabinoid Receptor CB1 (Cell,2016/10/20) ※上掲5tgz → Jmolトピック
Native phasing of x-ray free-electron laser data for a G protein-coupled receptor(Science Advances,2016/09/23) ※上掲5k2a-5k2d
血管収縮因子エンドセリンの受容体初期活性化機構を解明(SPring-8,2016/09/06) ※上掲5glh(エンドセリン-1結合)・5gli(受容体のみ) → Jmolトピック
構造生物学: さまざまなGPCRの構造中に存在する共通項(Nature ハイライト,2016/08/25)
Structure-based discovery of opioid analgesics with reduced side effects(Nature,2016/08/17)
September 2016 - Trends in Endocrinology & Metabolism(2016/07/29)
Structure of the adenosine A2A receptor bound to an engineered G protein(Nature,2016/07/27) ※上掲5g53
Structural role of the T94I rhodopsin mutation in congenital stationary night blindness(Primary Citation of Related Structures,2016/07/25) ※上掲5dys・5en0
生化学: GPCRでのアゴニスト結合(Nature ハイライト,2016/07/07)
Controlling the dissociation of ligands from the Adenosine A2A receptor through modulation of salt bridge strength(Journal of Medicinal Chemistry,2016/06/17) ※5iu4(上掲)・5iu7・5iu8・5iua・5iub
Extra-helical binding site of a glucagon receptor antagonist(Nature,2016/05/12) ※上掲5ee7
X-ray Crystallographic Structure of Thermophilic Rhodopsin: Implications for High Thermal Stability and Optogenetic Function(Journal of Biological Chemistry,2016/04/18) ※上掲5azd(Chain A)
Crystal structures of the M1 and M4 muscarinic acetylcholine receptors(Nature,2016/03/09) ※5cxvと5dsg(Chain A)を上掲
Structure and ligand-binding mechanism of the human OX1 and OX2 orexin receptors(Nature Structural & Molecular Biology,2016/03/07) ※4zj8を上掲
体内時計を調節するオーファンGPCRの同定 −生体リズム調整薬の開発に期待−(京都大学,2016/02/18) ※“今回新たに、G蛋白質共役受容体(GPCR)ファミリーに属するオーファン受容体分子Gpr176を同定”。
Ligand occupancy in crystal structure of β1-adrenergic G protein-coupled receptor(Nature Structural & Molecular Biology,2015/12/08) ※5f8uを上掲
化学生物学: オーファンGPCRのリガンドを探す(Nature ハイライト,2015/11/26)
Pharmacological Analysis and Structure Determination of 7-Methylcyanopindolol-Bound β1 -Adrenergic Receptor(Mol.Pharmacol.,2015/09/18) ※5a8eを上掲
PDBsumデータ5a8e_XTK(7-メチルシアノピンドロール結合)と4bvn_P32(シアノピンドロール結合)の比較;○ のメチル基のみ異なる
構造生物学: GPCR機能の普遍的機構(Nature ハイライト,2015/08/13)
Structural insights into μ-opioid receptor activation(Nature,2015/08/05) ※5c1mを上掲 → Jmolトピック
構造生物学: アレスチンのGPCRへの結合(Nature ハイライト,2015/07/30)
Fragment and Structure-Based Drug Discovery for a Class C GPCR: Discovery of the mGlu5 negative allosteric modulator HTL14242 (3-chloro-5-[6-(5-fluoropyridin-2-yl)pyrimidin-4-yl]benzonitrile)(Journal of Medicinal Chemistry,2015/07/30) ※5cgc・5cgd(こちらを上掲) → Jmolトピック
CCR5 and HIV Infection(SBKB,2015/01) ※4mbsを上掲
Crystal structure of the human OX2 orexin receptor bound to the insomnia drug suvorexant(Nature,2014/12/22) ※4rnbを上掲(現在4s0v に置換)
→ Jmolトピック
Modified T4 Lysozyme Fusion Proteins Facilitate G Protein-Coupled Receptor Crystallogenesis(Structure,2014/11/04) ※4u14を上掲,2012年ノーベル化学賞受賞のKobilkaらによる。
Gタンパク質共役受容体の立体構造解析を推進する製薬企業とアカデミアによる新たな国際的研究組織が設立される(小野薬品,2014/10/29) [PDF]
Beta 2 adrenergic receptor: A Nobel protein helping you breathe more easily(PDBe,2014/09/15)
VIDEO
Crystal structure of a common GPCR-binding interface for G protein and arrestin(Nature,2014/09/10) ※4pxfを上掲
High-resolution structure of the human GPR40 receptor bound to allosteric agonist TAK-875(Nature,2014/07/20) ※上掲4phu
Structural basis for Smoothened receptor modulation and chemoresistance to anticancer drugs(Nature,2014/07/10) ※4qinを上掲
Structure of class C GPCR metabotropic glutamate receptor 5 transmembrane domain(Nature,2014/07/06) ※4oo9を上掲
Agonist-bound structure of the human P2Y12 receptor(Nature,2014/04/30) ※2014/04/30公開データ4pxz(上掲)・4py0
Structure of the human P2Y12 receptor in complex with an antithrombotic drug(Nature,2014/03/23) ※4ntjを上掲
Serial Femtosecond Crystallography of G Protein-Coupled Receptors(Science,2013/12/20) ※4nc3を上掲
Structure of the human glucagon class B G-protein-coupled receptor(Nature,2013/07/17) ※4l6rを上掲
Structure of class B GPCR corticotropin-releasing factor receptor 1(Nature,2013/07/17) ※4k5yを上掲
GIRK2-Gタンパク質βγ二量体の構造(Natureハイライト,2013/06/13) ※上掲4kfmの12量体参照;2003年ノーベル化学賞受賞のR. Mackinnonらによる
参考:本ページについて日本コンピュータ化学会2013春季年会(2013/05/30-31,東京工業大学 大岡山キャンパス) でポスター発表しました(プログラム ,1P15 要旨PDF )。 → 当日ポスターパワポ抜粋(slideboom)
構造生物学: smoothened受容体の構造(Nature ハイライト,2013/05/16) ※上掲4jkvのChain A 参照
『研究最前線(2) 脂質ラフトから生命の根源に迫る』,理研ニュース,2013年5月号
Exploring the Elusive World of Life’s Most Vital Proteins(LiveScience,2013/04/17)
「アンジオテンシンII」が塩味感覚を変化させてNa+摂取量を制御する ─九大(マイナビニュース,2013/04/16)
Insights into congenital stationary night blindness based on the structure of G90D rhodopsin(EMBO reports,2013/04/12) ※上掲4bey参照(ロドプシン変異体G90D;先天停止性夜盲)
36年ぶりの新発見! 光でナトリウムイオンを輸送するポンプ型タンパク質!! 〜脳神経研究の新規ツール開発への期待〜(JST,2013/04/10)
パーキンソン病治療に貼付型ドパミン受容体刺激薬登場 24時間の症状改善に期待,福岡大・坪井義夫氏(MT Pro,2013/04/05) ※ロチゴチン(Rotigotine)。
岩田 想,『[2012年度ノーベル賞受賞者の業績と人柄][化学賞]細胞情報の伝達,そして人間の英知の伝承』,科学,2013年1月号
肥満に関わる膜タンパク質GPRC5Bの機能を解明 ―脂肪細胞膜上にあるGPRC5Bが脂質代謝を制御する―(理研,2012/11/21)
【UEGW事後特集】新規μオピオイド受容体拮抗薬TD-1211 フェーズ2bで疼痛治療の便秘を有意に改善示す(ミクスOnline,2012/11/04)
小野薬品工業.仏ドメイン社とGタンパク質共役型受容体に関する創薬で提携(QLifePro医療ニュース,2012/10/29)
Cover Story: 鎮痛剤が結合する「急所」:主なオピオイド受容体サブグループ4つの結晶構造が明らかに(Nature,2012/05/17)
Crystal structure of the μ-opioid receptor bound to a morphinan antagonist(Nature,2012/03/21) ※4dklを上掲,PDBsumデータ画像は5c1m記事 に併記
認知症や心機能の抑制に関係する受容体の立体構造を世界で初めて解明 −より効果的で副作用のない治療薬の探索・設計が可能に−(京都大学,2012/01/26) ※上掲3uon参照
花粉症・アレルギーの発症因子の立体構造を世界で初めて解明−副作用を抑えた治療薬の探索・設計が可能に−(京都大学,2011/06/23)
Structure of a nanobody-stabilized active state of the β2 adrenoceptor(Nature,2011/01/12) → Jmolトピック
新しい受容体メカニズムの解明と創薬(神経研NEWS,2006/03)
β2 アドレナリン受容体-Gタンパク質複合体構造例3sn6 ※中央図:伊東 広『〔化学賞〕GPCR研究の“三つの”ブレークスルー ─レフコヴィッツ博士とコビルカ博士の業績』,化学 2012年12月号(特集:2012年ノーベル賞を読み解く)
【参考】同解説p.15『第2のブレークスルー 遺伝子配列の決定』をもとに作成:7回膜貫通構造の類似性の例 ※βAR はPDB 3SN6より,OPS (ロドプシン)は同1F88 A鎖より(赤字 は解説と異なるアミノ酸で,解説ではVal でPDBデータではGlu )
βAR
Tyr
Ala
Ile
Ala
Ser
Ser
Ile
Val
Ser
Phe
Tyr
Val
Pro
Leu
Val
Ile
Met
Val
Phe
Val
Tyr
Ser
Arg
Val
Phe
Gln
Glu
OPS
Phe
Val
Ile
Tyr
Met
Phe
Val
Val
His
Phe
Ile
Ile
Pro
Leu
Ile
Val
Ile
Phe
Phe
Cys
Tyr
Gly
Gln
Leu
Val
Phe
Thr
Val
βAR
Leu
Gly
Ile
Ile
Met
Gly
Thr
Phe
Thr
Leu
Cys
Trp
Leu
Pro
Phe
Phe
Ile
Val
Asn
Ile
Val
His
Val
Ile
Gln
Asp
OPS
Met
Val
Ile
Ile
Met
Val
Ile
Ala
Phe
Leu
Ile
Cys
Trp
Leu
Pro
Tyr
Ala
Gly
Val
Ala
Phe
Tyr
Ile
Phe
Thr
His
Gln
βAR
Asn
Ser
Gly
Phe
Asn
Pro
Leu
Ile
Tyr
Cys
Arg
Ser
Pro
Asp
Phe
Arg
Ile
Ala
Phe
Gln
Glu
Leu
Leu
Cys
OPS
Lys
Thr
Ser
Ala
Val
Tyr
Asn
Pro
Val
Ile
Tyr
Ile
Met
Met
Asn
Lys
Gln
Phe
Arg
Asn
Cys
Met
Val
Thr
Thr
Leu
Cys
κオピオイド受容体構造例(JDTic結合)4djh
ヒスタミンH1 受容体3rze 中のドキセピン(3E体 と3Z体 ) ※花粉症・アレルギーの発症因子の立体構造を世界で初めて解明−副作用を抑えた治療薬の探索・設計が可能に−(京都大学,2011/06/23)
センソリーロドプシンII構造例1h2s ※柳田敏雄・木下賢吾・笠原浩太・木寺詔紀・林 重彦・江口至洋・高木 周,「岩波講座 計算科学4 計算と生命」,p.80,岩波書店(2012)
ケモカイン受容体CXCR1(IL-8A受容体の別名)2lnl 中のModel 1 ※Natureハイライト: 膜内のCXCR1の構造(2011/11/29)
ウシロドプシンPDB 3PQRの新生体分子模型Kawakami Model(写真掲載) ※3Dプリンタによるタンパク質模型展示 (日本コンピュータ化学会@サイエンスアゴラ2012 )
GPCR研究の概観と系譜 ※GPCR Target Tracking & Status (GPCR Network) [URL変更] とNature Review より。