◆ Jmolアニメ ◆
川上モデル同 リガンドだけ模型ecosci.jpの出張講座
科学とアート
※各模型画像の下のリンクページはJavaが動作するパソコンのブラウザ(Internet Explorer)でご覧ください。







川上モデル|分子・結晶・リガンド模型

原子・分子とビッグヒストリー



呼吸鎖の複合体I
書籍紹介トピック: ニック・レーン「生命、エネルギー、進化」(みすず書房)
第100回サイエンスカフェにいがた『科学書を翻訳するという仕事』(2017/09/10,新潟市)


[上]オートファジー関連 [下]チューブリン関連
書籍紹介トピック: 池田善昭・福岡伸一,「福岡伸一、西田哲学を読む」(明石書店)



鉄硫黄クラスターを含む生体分子のSITE例


光合成に関係する生体分子のSITE例(歪んだ椅子)


窒素から見る生命の世界

関連Jmolトピック
  
Mo化合物,W化合物を含む生体分子のSITE例

ヘモグロビン


チューブワーム由来ヘモグロビンPDB 1YHU(24量体)とヒトのヘモグロビンPDB 1HHO(4量体,オキシヘモグロビン)
ヘモグロビンチューブワーム関連データのSITE例
※参考: 深海2017(国立科学博物館)

DNAとRNAのいろいろな姿


PDBデータ4oo8のChain A-C(Cas9タンパク質-ガイド鎖RNA-標的DNAの複合体;CRISPR/Cas9関連)
CRISPR関連生体分子データ ─ゲノム編集を考える

アルツハイマー病患者の脳に蓄積するタウタンパク質フィラメント
アルツハイマー病治療薬
※参考: Tau protein - Wikipedia

β2アドレナリン受容体-Gタンパク質複合体構造例 PDBデータ3sn6
GPCR - 2012年ノーベル化学賞

フラーレン(C60)結合ペプチド5et3のPDBsumデータ
Jmolトピック

カーボンナノベルト(carbon nanobelt;CNB)
Jmolトピック

新抗生物質シュードウリジマイシン(pseudouridimycin)
Jmolトピック
  
自然免疫に関係するToll様受容体の例;2本鎖RNAを含むTLR3の構造例 PDBデータ3ciy
Toll様受容体
 

2014年は世界結晶年!
2015年は国際光年!

危険ドラッグ
(モル・タロウ着色;画像はAKB48〔APINACA〕)

ジカウイルスの構造例5ireの360量体(Chain A-F×60)
Jmolで見るジカウイルス

PDBデータ3av1(ヒストンH3.2変異体を含むヒトのヌクレオソーム構造)
Jmolトピックヌクレオソーム関連別トピック
  
[左]イベルメクチンB1a [右]PDBデータ3rhw(イベルメクチンが結合)
Jmolトピック(2015年ノーベル生理学医学賞)

2014年にエボラ出血熱感染拡大


分子モデルで見るノーベル賞


= Jmolカラーによる3Dプリンタ模型(川上モデル) =

  
ヘモグロビン


    
ウシロドプシンPDB 3PQR
  
光合成に関係する生体分子PDB 3ARC
  
Oct1/Sox2/DNA 複合体 - iPS細胞の山中因子から(右はPyMOLで作成)

川上モデル|分子・結晶・リガンド模型

  
[左]本ページへのQRコード
[右]DropboxとChem3D for iPadで分子を見るへのQRコード


「生活環境化学の部屋」ホームページJmol版「分子の学習帳」DropboxとChem3D for iPadで分子を見る